ASGARD - Plateforme d'analyse et de séquençage génomiques avancés pour la recherche et le diagnostic - Entreprises

Discipline : Biologie, Santé, génomique, bioinformatique

La plateforme technologique ASGARD mutualise des équipements et compétences reconnues en séquençage de nouvelles générations pour répondre aux besoins de la communauté scientifique.

Secteur d’application

Recherche et diagnostic
Toutes espèces
Études de génomes entiers
Études d’exomes
Études de panel de gènes

Expertises scientifiques

Qualification des échantillons
Séquençage « short read » : génomes, exomes, panels de gènes, transcriptomes (RNA-Seq)
Séquençage « long read » : génomes, panels de gènes
Préparation des librairies, automatisation
Traitement des données
Analyses des données de séquençage
Accompagnement de projets

Équipements remarquables

Séquenceurs « long read » : Revio (Pacbio) et P2 Solo (ONT)
Séquenceur « short read » très haut débit : NovaSeq 6000 (Illumina)
Séquenceur « short read » moyen débit : NextSeq 550 (Illumina)
Séquenceurs « short read » faible débit : MiSeq (Illumina)
Automate de préparation de librairies Fluent 980 (Tecan)
Automate de préparation de librairies Magnis (Agilent)
Matériel annexes : Tapestation 4200 (Agilent), FemtoPulse (Agilent), sonicateur d’ADN S220 (Covaris), fragmenteur mécanique d’ADN Megaruptor 3 (Diagenode), Qubit et FluoroSkan (Thermo Fisher Scientific)
Cluster de calcul et de stockage de données CEREBRO

Modalités de l’offre de service

Accès à certains équipements de la plateforme
Prestations de service et de recherche à destination des académiques, entreprises locales et nationales
Collaboration de recherche et développement

Informations pratiques

Responsable scientifique plateforme : Gael Nicolas – gael.nicolas1@univ-rouen.fr
Responsable opérationnelle : Céline Derambure – celine.derambure1@univ-rouen.fr

Contact : ngs_staff@listes.univ-rouen.fr

Site internet : https://cbg.univ-rouen.fr/plateformes/plateforme-asgard/

Lieu : UFR Santé, bâtiment recherche (CRIS)