SequAna – Plateforme de bioinformatique et biostatistiques

Discipline : Bioinformatique et biostatistiques

Plateforme technologique pluridisciplinaire de bioinformatique et biostatistiques pour le traitement et l’analyse des données d’ADN/ARN issues du séquençage à haut débit (NGS). Elle conçoit des chaînes de traitement et des solutions logicielles, évolutives et personnalisées selon les besoins des chercheurs, en s’appuyant sur des outils open-source de pointe. Son activité d’analyse couvre l’ensemble du flux, depuis la gestion de la donnée brute jusqu’à l’analyse fonctionnelle. SequAna assure une démarche qualité du premier rendez-vous à la livraison finale des résultats.

Secteur d’application

• Biomédical
• Biotechnologies
• Agronomie
• Environnement
• Cosmétique

Expertises scientifiques

• Génomique des microorganismes (assemblage, annotations, variabilité)
• Épigénomique (ChIP-Seq, ATAC-seq)
• Transcriptomique différentielle et fonctionnelle (bulk, single-cell, spatial)
• Métagénomique taxonomique et fonctionnelle (metabarcoding, shotgun)

Équipements et pratiques remarquables

• Chaîne de traitements et d’analyses : outils open source et interopérables
• Démarche qualité (pratiques FAIR)
• Serveurs de calcul, stockage (traçabilité et accès privé aux résultats)

Modalités de l’offre de service

• Prestations de service et de recherche à destination des académiques, entreprises locales et nationales
• Collaboration de recherche et développement

Unité de service

Tutelles

Financeurs de la plateforme